1989年至2003年，安仁县在普及初等教育的基础上，教育工作重点改为普及九年制义务教育，县、乡、村加大教育投入力度，发动群众，多渠道筹措教育资金，积极改善办学条件；加强义务教育执法，采取多种措施，动员适龄儿童、青少年入学；运用多种形式，积极扫除青壮年文盲。1997年10月，全县基本普及九年义务教育和基本扫除青壮年文盲验收达标。同年12月，省人民政府给安仁颁发“合格县”奖牌。1998年，深化教育体制改革，形成了国家公办、国有民办、民办多种办学格局，并逐步转变教育行政管理职能，依法建立和完善学校管理制度，引进竞争机制，扩大学校办学自主权，在学校推行“校长负责制”、“教职工聘任制”和“后勤分离制”。2001年，县委、县政府作出了整合教育资源，合理调整学校布局的决定，全县共撤并村级小学61所。到2003年，全县有幼儿园37所，学前班138个，小学184所，普通中学35所（其中民办中学4所），年总计在校学生5.2万余人。

2003年底，全县中小学教职工（包含局机关、教师进修学校和县一、二幼儿园）共计4261人。按学校层次分：高中437人，其中专任教师333人，专任教师学历合格率60%；中学高级教师72人，占专任教师21.6%；中学一级教师114人，占专任教师34.2%；中学二、三级教师147人，占专任教师44.1%。初中1362人，其中专任教师1206人，专任教师学历合格率97.4%；中学高级教师17人，占专任教师1.4%；中学一级教师364人，占专任教师30.2%；中学二、三级教师825人，占专任教师68.4%。小学2320人，其中专任教师2231人，专任教师学历合格率98%；中学高级教师5人，占专任教师0.23%；小学高级教师822人，占专任教师36.8%；小学一、二级教师1415人，占专任教师60.9%。全县4261名中小学教师中有1394人被评为中级和中级以上职称。15年内，全县为大中专院校输送学生8066人。